Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms