Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y9

KLF13, Krueppel-like factor 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF13Q9Y2Y9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
KLF13Q9Y2Y9 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF13Q9Y2Y9 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms