Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms