Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ABCF2Q9UG63 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ABCF2Q9UG63 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms