Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT172Q9UG01 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms