Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP2Q9UDT6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms