Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLKQ9UBT6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms