Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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RDH8Q9NYR8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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RDH8Q9NYR8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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