Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms