Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms