Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMBRD1Q9NUN5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms