Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms