Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms