Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms