Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZD3

GCOM2, Putative GRINL1B complex locus protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCOM2Q9BZD3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCOM2Q9BZD3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCOM2Q9BZD3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GCOM2Q9BZD3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GCOM2Q9BZD3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCOM2Q9BZD3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCOM2Q9BZD3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCOM2Q9BZD3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCOM2Q9BZD3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GCOM2Q9BZD3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GCOM2Q9BZD3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCOM2Q9BZD3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCOM2Q9BZD3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCOM2Q9BZD3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCOM2Q9BZD3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCOM2Q9BZD3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCOM2Q9BZD3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCOM2Q9BZD3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCOM2Q9BZD3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCOM2Q9BZD3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GCOM2Q9BZD3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCOM2Q9BZD3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms