Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01892-202ENST00000583985 540 ntTSL 4 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC096732.1-201ENST00000439565 477 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092164.1-203ENST00000444501 723 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZRANB2-AS2-205ENST00000455406 783 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011632.1-203ENST00000522914 454 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELOC-208ENST00000523815 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC015878.2-201ENST00000584331 361 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms