Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM0

PRX, Periaxin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRXQ9BXM0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRXQ9BXM0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRXQ9BXM0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRXQ9BXM0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRXQ9BXM0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRXQ9BXM0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRXQ9BXM0 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRXQ9BXM0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRXQ9BXM0 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRXQ9BXM0 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRXQ9BXM0 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PRXQ9BXM0 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRXQ9BXM0 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PRXQ9BXM0 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRXQ9BXM0 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRXQ9BXM0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRXQ9BXM0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRXQ9BXM0 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRXQ9BXM0 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRXQ9BXM0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRXQ9BXM0 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRXQ9BXM0 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRXQ9BXM0 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRXQ9BXM0 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PRXQ9BXM0 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRXQ9BXM0 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRXQ9BXM0 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PRXQ9BXM0 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PRXQ9BXM0 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRXQ9BXM0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRXQ9BXM0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRXQ9BXM0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRXQ9BXM0 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRXQ9BXM0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRXQ9BXM0 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms