Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms