Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms