Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms