Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms