Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms