Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms