Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms