Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC12Q8WUD4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms