Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms