Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms