Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDXQ7Z353 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HDXQ7Z353 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HDXQ7Z353 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HDXQ7Z353 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HDXQ7Z353 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HDXQ7Z353 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HDXQ7Z353 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDXQ7Z353 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDXQ7Z353 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDXQ7Z353 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDXQ7Z353 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDXQ7Z353 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDXQ7Z353 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDXQ7Z353 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDXQ7Z353 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDXQ7Z353 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDXQ7Z353 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDXQ7Z353 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDXQ7Z353 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDXQ7Z353 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDXQ7Z353 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDXQ7Z353 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDXQ7Z353 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDXQ7Z353 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDXQ7Z353 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDXQ7Z353 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDXQ7Z353 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDXQ7Z353 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDXQ7Z353 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HDXQ7Z353 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms