Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms