Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD1Q6UXZ0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms