Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms