Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms