Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms