Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms