Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms