Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms