Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms