Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms