Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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HIST2H2BEQ16778 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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HIST2H2BEQ16778 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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HIST2H2BEQ16778 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
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