Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
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