Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms