Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms