Protein–RNA interactions for Protein: Q15327

ANKRD1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD1Q15327 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD1Q15327 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD1Q15327 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD1Q15327 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD1Q15327 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD1Q15327 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD1Q15327 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD1Q15327 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms