Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms