Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSPNQ14714 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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