Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms