Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTTNQ14247 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTTNQ14247 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTTNQ14247 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTTNQ14247 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTTNQ14247 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTTNQ14247 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTTNQ14247 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTTNQ14247 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTTNQ14247 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTTNQ14247 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTTNQ14247 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTTNQ14247 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTTNQ14247 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTTNQ14247 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTTNQ14247 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTTNQ14247 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTTNQ14247 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTTNQ14247 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTTNQ14247 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTTNQ14247 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CTTNQ14247 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTTNQ14247 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTTNQ14247 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTTNQ14247 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CTTNQ14247 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTTNQ14247 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTTNQ14247 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTTNQ14247 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTTNQ14247 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms