Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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