Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
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SHROOM2Q13796 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
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SHROOM2Q13796 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
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SHROOM2Q13796 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
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SHROOM2Q13796 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
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