Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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